#include<stdio.h>
void fun(char *st,int n,int m)
{
	char *p1,*p;
	p=st;
	while(p<st+m)
	{
		p++;
		p1++;
	}
	for(p=st+m;p<st+n;p++)
	{
		*p=*p1;
		*p++;
		*p1++;
	}
	*p1="\0";
}
main()
{
	char st[20];
	int i;
	printf("please input a string:\n");
	scanf("%d",&i);
	fun(st,20,i);
	printf("%s",st);
}

你的scanf 到底要拿什么？

你应该先输入原始字符串……
然后输入替换位置
最后输入要替换的字符串

        你是想输入i 作为替换开始的位置吧
但有一个大问题在于fun（）函数里的指针变量p1 一开始你就没有绑定指向的位置，这样p1是一个野指针非常危险，之后你又p1++，然后*p1，p1你都不知道指向哪儿怎么取值呢？
建议养成好习惯，每定义一个指针变量马上给他绑定

#include<stdio.h>
void fun(char *st,int n,int m)
{
    char *p1,*p;    //p1野指针
    p=st;
    while(p<st+m)
    {
        p++;
        p1++;    //此处加没有意义
    }
    for(p=st+m;p<st+n;p++)    //此处p在上面做了++此处p又指向了st+m,则上面的操作没意义
    {
        *p=*p1;
        *p++;
        *p1++;
    }
    *p1="\0";
}
main()
{
    char st[20];
    int i;
    printf("please input a string:\n");
    scanf("%d",&i);
    fun(st,20,i);    //st没有初始化和赋值,所以调用函数fun没有意义
    printf("%s",st);
}

对多处做了注释,问题先逐步修改；问题也比较模糊,建议你在提问时,可以适当举个例子,让别人能理解你的需求和要求；

VS环境

#define _CRT_SECURE_NO_DEPRECATE  
#include <stdio.h>  
#include <string.h>  
/******************************************************************** 
*  Function：  my_strstr() 
*  Description: 在一个字符串中查找一个子串; 
*  Input：      ps: 源;      pd：子串 
*  Return :    0：源字符串中没有子串; 1：源字符串中有子串; 
*********************************************************************/  
char * my_strstr(char * ps, char *pd)  
{  
    char *pt = pd;  
    int c = 0;  
    while (*ps != "\0")  
    {  
        if (*ps == *pd)  
        {  
            while (*ps == *pd && *pd != "\0")  
            {  
                ps++;  
                pd++;  
                c++;  
            }  
        }  
        else  
        {  
            ps++;  
        }  
        if (*pd == "\0")  
        {  
            return (ps - c);  
        }  
        c = 0;  
        pd = pt;  
    }  
    return 0;  
}  
  
/******************************************************************** 
*  Function：  my_memcpy() 
*  Description: 复制一个内存区域到另一个区域; 
*  Input：      src: 源; 
count: 复制字节数. 
*  Output：      dest: 复制目的地; 
*  Return :      dest; 
*********************************************************************/  
void * my_memcpy(void * dest, const void *src, size_t count)  
{  
    char *tmp = (char *)dest, *s = (char *)src;  
    while (count--)  
        *tmp++ = *s++;  
    return dest;  
}  
  
/******************************************************************** 
*  Function：  str_replace() 
*  Description: 在一个字符串中查找一个子串，并且把全部符合的子串用 
另一个替换字符串替换。 
*  Input：      p_source:要查找的母字符串； p_seach要查找的子字符串; 
p_repstr：替换的字符串; 
*  Output：      p_result:存放结果; 
*  Return :      返回替换成功的子串数量; 
*  Others:      p_result要足够大的空间存放结果，所以输入参数都要以\0结束; 
*********************************************************************/  
int str_replace(char *p_result, char* p_source, char* p_seach, char *p_repstr)  
{  
    int c = 0;  
    int repstr_leng = 0;  
    int searchstr_leng = 0;  
    char *p1;  
    char *presult = p_result;  
    char *psource = p_source;  
    char *prep = p_repstr;  
    char *pseach = p_seach;  
    int nLen = 0;  
    repstr_leng = strlen(prep);  
    searchstr_leng = strlen(pseach);  
  
    do {  
        p1 = strstr(psource, p_seach);  
        if (p1 == 0)  
        {  
            strcpy(presult, psource);  
            return c;  
        }  
        c++;  //匹配子串计数加1;  
        //printf("结果:%s\r\n", p_result);  
        //printf("源字符:%s\r\n", p_source);  
        // 拷贝上一个替换点和下一个替换点中间的字符串  
        nLen = p1 - psource;  
        memcpy(presult, psource, nLen);  
        // 拷贝需要替换的字符串  
        memcpy(presult + nLen, p_repstr, repstr_leng);  
        psource = p1 + searchstr_leng;  
        presult = presult + nLen + repstr_leng;  
    } while (p1);  
  
    return c;  
}  
#define MAX 200  
int main(void)  
{  
    int i = 0;  
    char s[MAX] = { 0 };        //存放源字串  
    char s1[MAX] = { 0 };        //存放子字串  
    char s2[MAX] = { 0 };        //存放替换字串  
    char result_a[2000] = { 0 };//存放替换结果;  
    puts("Please input the string for s:");  
    gets_s(s,MAX);  
    puts("Please input the string for s1:");  
    gets_s(s1, MAX);  
    puts("Please input the string for s2:");  
    gets_s(s2, MAX);  
    i = str_replace(result_a, s, s1, s2);  
    printf("替换%d个子字符串;\r\n", i);  
    printf("替换后结果:%s\r\n", result_a);  
	return 0;
}  

建议先养个好习惯：变量名 尽量用英文 见名知意 ，不然一周后你本人看代码又得花很长时间。
函数前面写一段注释 说明这个函数做什么的，返回值是什么，需要特别注意的是什么。
至于这段代码的问题 楼上的都给你解决了。